آنچه از دید منتقدان دانشنامه نادیده گرفته شده است نگاه کمّی دانشنامه در انتخاب و نگارش مدخل‌ها بوده است. برای هرکدام از موضوعات دانشنامه معیار‌هایی تعیین شده است که اغلب کمّی است نه کیفی و تحلیلی تا دامنه و نگاه حداکثری به جامعۀ هزاره را شامل شود. ابوطالب مظفری، رئیس شورای علمی دانشنامه در نشست نقد و بررسی جلد اول دانشنامه، گفت: این نگاه عموماً از سوی منتقدان نادیده گرفته می‌شود. آقای مظفری به عنوان نمونه درباره ملاک‌های مدخل‌گزینی شخصیت‌ها گفت: در این شیوه ملاک‌های مانند ردپای شخص در منابع، داشتن آثار مکتوب و فعالیت‌های اجتماعی را نام برد که ممکن است در این روند افراد بسیار فاضلی که در گوشۀ انزوا بوده از قلم مانده باشد و این به معنی نادیده گرفتن ارزش آن فرد یا افراد نیست. در این مورد مثالی از دانشنامه مطرح کرد، مدخل اوری جان، دختر مامای عبدالخالق، که در کتب تاریخی، نامی از او آمده و مخاطب از آن پرسش می‌کند حال این بندۀ‌ خدا، یک بانوی زجر کشیده بوده و هیچ مشخصۀ بارز علمی و اجتماعی ندارد. قانون دانشنامه‌نگاری حکم می‌کند که به فرد در حد امکان پرداخته شود.