مدخل‌های دانشنامۀ هزاره در ۳۵ موضوع دسته‌بندی و ثبت شده است:
۱. آب‌های معدنی؛
۲. آبدات (مزارها، قلعه‌ها، پیکره‌ها و مجسمه‌های باستانی)؛
۳. احزاب، گروه‌ها و انجمن‌ها؛
۴. مراکز آموزشی و فرهنگی و کتابخانه‌ها؛
۵.مذهب (فرقه‌های مذهبی و صوفیه)؛
۶. مناطق جغرافیایی (ولایت، ولسوالی، منطقه و قریه)؛
۷. جغرافیای تاریخی (تمام مناطقی که در گذشته محل بودوباش هزاره‌ها بوده است)؛
۸. پدیده‌های طبیعی (کوه، رود، دره، غار، جنگل)؛
۹. گیاهان (دارویی و غیردارویی)؛
۱۰. جانوران؛
۱۱. محصولات (زراعتی، باغی و حیوانی)؛
۱۲. ابزارها؛
۱۳. صنایع دستی؛
۱۴. معادن؛
۱۵. شخصیت‌های فرهنگی (مستندساز، شاعر، نویسنده، محقق، خطاط، نقاش، آواز‌خوان، بازیگر و ورزشکار)؛
۱۶. شخصیت‌های سیاسی و اجتماعی؛
۱۷.شخصیت‌های مذهبی؛
۱۸.شخصیت‌های علمی (مخترعان و دانشمندان، صاحب‌نظران علوم و فنون)؛
۱۹. رسانه‌ها (مجله، روزنامه، سایت، تلویزیون و رادیو)؛
۲۰. کتاب‌ها؛
۲۱. طوایف (دای‌ها، طایفه‌ها، قبیله‌ها)؛
۲۲. آوازها؛
۲۳. آلات موسیقی؛
۲۴. امراض و شیوۀ تداوی آن‌ها؛
۲۵. غذاها؛
۲۶. بازی‌ها؛
۲۷. افسانه‌ها؛
۲۸. آداب و رسوم (رسوم مذهبی، عرفی و فرهنگی)؛
۲۹. مشاغل؛
۳۰. وقایع و رویدادهای تاریخی؛
۳۱. شخصیت‌های تاریخی (پادشاهان، علماء و شخصیت‌های معروف قدیمی)؛
۳۲. معماری (انواع و اجزای خانه‌های هزارگی)؛
۳۳. ژانر ادبی؛
34. عنوان‌های اجتماعی؛
35. موضوعات متفرقه.